Profil taksonomi dan kapasitas stimulasi interferon-α dari partikel mirip virus usus pada pasien dengan lupus eritematosus sistemik. Kredit: Science China Press
Systemic lupus erythematosus (SLE) adalah penyakit autoimun prototipikal yang dapat mempengaruhi banyak jaringan dan organ. Manifestasi umum SLE meliputi demam, kelelahan, ruam malar, sariawan, alopesia, artritis, dan nefritis. Wanita usia subur paling mungkin menderita SLE. Saat ini, tidak ada obat untuk SLE, dan tidak ada rejimen pengobatan yang efektif dan aman karena etiopatogenesis dasarnya tetap sulit dipahami.
Mikrobiota usus mengacu pada komunitas mikroba yang menyebar di sepanjang permukaan mukosa saluran pencernaan. Mikroba usus berpartisipasi dalam pengembangan dan fungsi sistem kekebalan inang. Mikrobiota usus yang terganggu telah dikaitkan dengan patogenesis penyakit autoimun seperti SLE. Namun, mengingat keterbatasan teknis, penelitian sebelumnya sebagian besar berfokus pada bakteri usus yang melimpah, sedangkan virom usus pasien SLE masih kurang dieksplorasi.
Sebuah studi yang dipimpin oleh Prof. Xuan Zhang (Rumah Sakit Beijing) dan Prof. Jun Wang (Akademi Ilmu Pengetahuan China) merekrut 76 pasien SLE dan 75 peserta sehat yang cocok, dan mengumpulkan feses mereka. Pasien SLE sebagian besar naif pengobatan dan tidak menggunakan kortikosteroid, imunosupresan, atau antimalaria selama 3 bulan sebelumnya. Sel manusia dan sel bakteri dikeluarkan dari tinja dan partikel seperti virus bebas (VLP) diperkaya dengan ultrasentrifugasi. Kemudian, asam nukleat virus diekstraksi dan diprofilkan dengan pengurutan senapan.
Karya tersebut diterbitkan dalam jurnal Science Bulletin.
Kekayaan komunitas, kemerataan, dan distribusi VLP usus tidak berbeda secara signifikan antara pasien SLE dan peserta sehat. Namun, proporsi bakteriofag, virus yang menginfeksi bakteri dan bukan sel manusia, secara signifikan lebih tinggi pada pasien SLE dibandingkan peserta yang sehat.
Mengenai genera dan spesies virus yang melimpah secara berbeda, yang paling diskriminatif pada pasien SLE adalah Drulisvirus, Thermoanaerobacterium phage THSA-485A, Caeruleovirus, dan virus Bacillus JBP901, sedangkan yang dominan untuk HCs adalah virus mirip crAss dan salah satu spesiesnya, Fag selulofaga phi14:2.
Menariknya, kelimpahan usus Staphylococcus phage phiRS7 yang diperkaya SLE berhubungan positif dengan indeks aktivitas penyakit SLE serta tingkat indikator inflamasi, termasuk protein C-reaktif dan tingkat sedimentasi eritrosit.
Interkorelasi antara virom usus dan bakteri juga dianalisis. Menggunakan analisis Procrustes, ditemukan hubungan transkingdom yang signifikan antara komunitas virus dan bakteri dalam mikrobiota usus. Selain itu, beberapa bakteriofag ikut bervariasi dengan genera bakteri yang bukan inangnya, menunjukkan interaksi yang rumit antara virome usus dan bakteriom.
Model diagnostik berdasarkan virus dan bakteri yang melimpah secara berbeda menggunakan algoritma hutan acak dibangun. Kombinasi penanda virus dan bakteri usus menunjukkan kinerja yang lebih baik (area di bawah kurva = 0,948) daripada menggunakan data dari satu kerajaan saja dalam membedakan pasien SLE dari peserta yang sehat.
Akhirnya, VLP diisolasi dari feses dan ditambahkan ke kultur sel manusia. VLP dari pasien SLE yang tidak diobati mempromosikan transkripsi dan produksi interferon-α, faktor patogen penting dalam SLE, baik dalam sel Caco (garis sel epitel) dan sel kekebalan yang dipisahkan dari darah manusia dibandingkan dengan VLP dari orang sehat. Menariknya, kapasitas stimulasi interferon berkurang pada VLP dari pasien SLE pasca perawatan.
Singkatnya, ini adalah profil VLP pertama dari virom usus pada pasien SLE yang mengungkapkan tanda tangan virus dalam mikrobiota usus pasien SLE. Ini juga memberikan wawasan baru tentang patogenesis SLE dengan menghubungkan viroma usus terkait SLE dengan produksi interferon-α yang dipromosikan.
Informasi lebih lanjut: Beidi Chen et al, Virom usus yang terganggu dengan sifat interferonogenik yang kuat pada lupus eritematosus sistemik, Buletin Sains (2023). DOI: 10.1016/j.scib.2023.01.021
Disediakan oleh Science China Press
Kutipan: Virom usus yang terganggu dengan sifat interferonogenik yang kuat pada lupus eritematosus sistemik (2023, 6 Maret) diambil 7 Maret 2023 dari https://medicalxpress.com/news/2023-03-disturbed-gut-virome-potent-interferonogenic.html
Dokumen ini tunduk pada hak cipta. Terlepas dari kesepakatan yang adil untuk tujuan studi atau penelitian pribadi, tidak ada bagian yang boleh direproduksi tanpa izin tertulis. Konten disediakan untuk tujuan informasi saja.