Memilih ambang batas untuk menyatakan skor poligenik “tinggi”. Kredit: BMJ (2023). DOI: 10.1136/bmj-2022-073149
Menguji populasi untuk beberapa gen sekaligus akan terbatas kemampuannya untuk secara akurat memprediksi risiko penyakit, kata sebuah makalah baru yang melibatkan Profesor Aroon Hingorani dari UCL.
Urutan DNA umumnya bervariasi antara individu di berbagai titik di seluruh genom. Beberapa varian genetik ini memengaruhi risiko individu terhadap penyakit umum seperti demensia, kanker, diabetes, dan penyakit kardiovaskular, melalui efek pada ekspresi atau fungsi protein yang disandikan. Efek dari varian ini pada risiko penyakit pada setiap individu dapat diringkas dengan menghasilkan skor risiko poligenik.
Klaim kuat telah dibuat tentang potensi transformatif skor risiko poligenik untuk prediksi, pencegahan, dan deteksi dini penyakit dan pengujian semacam itu telah menarik minat pembuat kebijakan dan sektor komersial.
Namun, dalam artikel analisis di British Medical Journal, peneliti klinis dari UCL, The Institute of Cancer Research, London, dan University of Oxford berpendapat bahwa kinerja prediktif dari tes semacam itu terbatas.
Rekan penulis Profesor Aroon Hingorani (UCL Institute of Cardiovascular Science), yang juga Pemimpin Tema Kardiovaskular untuk Pusat Penelitian Biomedis UCLH NIHR dan Konsultan Penyakit Dalam di UCLH, mengatakan, “‘skor poligenik’ di seluruh populasi secara inheren terbatas karena banyak kasus penyakit terjadi di antara orang-orang yang tidak memiliki skor poligenik tinggi dan banyak dari mereka yang memiliki skor poligenik tinggi tidak mengidap penyakit.”
Pengujian genetik NHS saat ini berfokus pada sejumlah kecil mutasi penyakit yang dipahami dengan baik yang sangat meningkatkan risiko penyakit—seperti BRCA1 dan BRCA2 pada kanker payudara dan ovarium.
Penilaian poligenik adalah jenis tes genetik berbeda yang melihat ribuan varian umum dalam DNA seseorang, yang masing-masing hanya akan berdampak kecil pada risiko, untuk mendapatkan penilaian kolektif dari risiko genetik penyakit.
Dua laporan Pemerintah baru-baru ini menunjukkan antusiasme yang tinggi terhadap skor poligenik dalam perawatan kesehatan dan menegaskan bahwa skor tersebut menawarkan “perubahan bertahap”‘ dalam skrining penyakit.
NHS kini bermitra dengan program penelitian terbesar di Inggris, Our Future Health, untuk menawarkan informasi risiko berdasarkan skor poligenik kepada lima juta orang dalam populasi Inggris. Informasi tersebut diharapkan untuk menginformasikan pengambilan keputusan klinis termasuk akses ke skrining.
Skor poligenik harus ‘dievaluasi dengan hati-hati’ dalam studi besar
Para penulis berpendapat bahwa risiko dan manfaat pengujian genetik harus dievaluasi secara hati-hati dalam penelitian besar. Analisis mereka menyimpulkan bahwa inisiatif yang menggunakan skor poligenik untuk menyaring orang yang berisiko terkena penyakit umum seperti kanker dan penyakit jantung akan kehilangan sebagian besar kasus dalam populasi.
Saat menyaring populasi untuk suatu penyakit menggunakan skor poligenik, banyak yang menganjurkan untuk menggunakan skor poligenik tinggi untuk menargetkan strategi skrining atau pencegahan penyakit. Menurut para peneliti, hal itu akan melewatkan sebagian besar penyakit dalam populasi dan menghasilkan sejumlah besar individu sehat yang menjalani tes invasif dan terapi yang tidak akan pernah berkembang menjadi penyakit.
Misalnya, NICE menggunakan 17% risiko kanker payudara seumur hidup sebagai ambang batas untuk menganggap wanita “berisiko sedang”. Tetapi dalam studi skor risiko poligenik yang juga menggunakan ambang ini, hanya 39% wanita yang akan mengembangkan kanker payudara memiliki skor risiko sedang atau tinggi, yang berarti sebagian besar kasus kanker payudara terlewatkan menggunakan skor ini. Sementara itu, 22% wanita yang tidak terkena kanker payudara akan memiliki skor risiko poligenik yang tinggi dan karenanya akan menjadi “positif palsu”.
Menempatkan skor dalam konteks
Para ilmuwan berpendapat bahwa karena skor risiko poligenik hanya menunjukkan sebagian kecil dari keseluruhan risiko penyakit, maka skor tersebut harus disajikan dalam konteks, dengan latar belakang risiko penyakit normal yang dikomunikasikan untuk dibandingkan dengan pasien dan dokter.
Misalnya, wanita di 5% teratas dari skor poligenik untuk kanker payudara memiliki risiko 19% seumur hidup terkena penyakit ini, dibandingkan dengan risiko populasi 11,8%.
Untuk kanker prostat, mereka yang memiliki skor risiko poligenik di 5% teratas membawa risiko 22% dibandingkan dengan risiko populasi 12,7%.
Perbedaan menjadi lebih sederhana pada kanker yang kurang umum. Misalnya, orang-orang di lima persen teratas dari skor poligenik untuk kanker ovarium memiliki risiko seumur hidup sebesar 2,1%, dibandingkan dengan risiko populasi sebesar 1,6%.
Para penulis menguraikan berbagai kekhawatiran tambahan dengan meluasnya penggunaan skor poligenik untuk menginformasikan pengambilan keputusan klinis — termasuk biaya dan kompleksitas skrining dan jalur diagnostik, dan risiko bahwa mereka akan mengekspos sejumlah besar orang dengan skor poligenik “tinggi” untuk mengikuti yang seringkali tidak perlu. tes -up.
Penulis utama Dr. Amit Sud, Dosen Klinis Akademik dalam Genetika dan Epidemiologi di The Institute of Cancer Research, London, mengatakan, “Ada antusiasme yang sangat besar tentang skor poligenik, dan mereka memiliki potensi untuk meningkatkan kemampuan kita untuk memprediksi siapa akan atau tidak akan mengembangkan penyakit, meskipun agak sederhana.
“Tapi kami berpendapat bahwa manfaat dan kerugian seputar penggunaan skor poligenik dievaluasi secara hati-hati sebelum diterapkan secara luas. Mengingat sebagian besar penyakit dalam suatu populasi terjadi pada orang yang tidak berisiko poligenik tinggi, skor ini tidak boleh mengurangi efektivitas penyaringan dan intervensi di seluruh populasi untuk mengatasi faktor risiko yang dapat dimodifikasi dan berdampak seperti merokok dan kekurangan sosial ekonomi.”
Informasi lebih lanjut: Amit Sud et al, Ekspektasi realistis adalah kunci untuk mewujudkan manfaat skor poligenik, BMJ (2023). DOI: 10.1136/bmj-2022-073149
Disediakan oleh University College London
Kutipan: Pengujian gen seluruh populasi memiliki kemampuan terbatas untuk memprediksi penyakit, kata para peneliti (2023, 3 Maret) diambil 4 Maret 2023 dari https://medicalxpress.com/news/2023-03-population-wide-gene-limited-ability -penyakit.html
Dokumen ini tunduk pada hak cipta. Terlepas dari kesepakatan yang adil untuk tujuan studi atau penelitian pribadi, tidak ada bagian yang boleh direproduksi tanpa izin tertulis. Konten disediakan untuk tujuan informasi saja.