Kredit: Domain Publik CC0
Para peneliti di University of Sussex menggunakan teknologi Kecerdasan Buatan (AI) untuk menganalisis berbagai jenis sel kanker untuk memahami ketergantungan gen yang berbeda, dan untuk mengidentifikasi gen yang sangat penting bagi kelangsungan hidup sel. Peneliti Sussex telah melakukan ini dengan mengembangkan algoritma prediksi yang menentukan gen mana yang penting dalam sel, dengan menganalisis perubahan genetik pada tumor. Ini dapat digunakan untuk mengidentifikasi target yang dapat ditindaklanjuti yang pada waktunya dapat memandu ahli onkologi untuk mempersonalisasi perawatan pasien kanker.
Frances Pearl, Dosen Senior Bioinformatika di School of Life Sciences di University of Sussex mengatakan, “Visi kami adalah memanfaatkan penurunan biaya pengurutan DNA dan memanfaatkan kekuatan AI untuk memahami perbedaan sel kanker dan apa yang maksudnya untuk pengobatan pasien secara individu Melalui penelitian kami, kami dapat mengidentifikasi ketergantungan gen spesifik sel hanya dengan menggunakan sekuens DNA dan tingkat RNA dalam sel tersebut, yang mudah dan murah diperoleh dari sampel biopsi tumor.
“Ini adalah langkah yang sangat menarik dalam penelitian kami yang berarti bahwa kami sekarang dapat bekerja untuk meningkatkan teknologi sehingga dapat ditawarkan kepada ahli onkologi dan membantu dalam jalur pengobatan untuk pasien mereka.”
Perawatan kanker terutama ditentukan berdasarkan lokasi dan jenis kanker. Perbedaan genetik pada tumor dapat membuat perawatan kanker standar menjadi tidak efektif. Menggunakan pendekatan yang dipersonalisasi untuk memandu pengobatan dapat meningkatkan harapan hidup, kualitas hidup, dan mengurangi efek samping yang tidak perlu dari pasien kanker.
Di setiap sel, terdapat sekitar 20.000 gen yang mengandung informasi yang dibutuhkan untuk membuat protein. Sekitar 1.000 dari gen itu penting, artinya diperlukan agar sel dapat bertahan hidup. Ketika sel normal menjadi sel kanker, onkogen (yaitu gen yang berpotensi menyebabkan kanker) menjadi aktif dan gen penekan tumor menjadi tidak aktif, menyebabkan pengkabelan ulang sel. Hal ini menyebabkan sel menjadi tergantung pada satu set gen baru untuk bertahan hidup, dan ini kemudian dapat dimanfaatkan untuk membunuh sel kanker.
Dengan menggunakan teknologi baru ini untuk menargetkan produk protein dari gen yang bergantung pada tumor spesifik, sel kanker dapat dibunuh, membuat sel normal yang tidak bergantung pada gen ini relatif tidak terluka. Meskipun dependensi dapat ditentukan dengan menggunakan teknik laboratorium intensif, biayanya mahal dan memakan waktu dan tidak layak untuk menganalisis semua sampel tumor dengan cara ini.
Karya tersebut diterbitkan dalam jurnal Bioinformatics Advances.
Informasi lebih lanjut: Graeme Benstead-Hume et al, Fitur topologi jaringan biologis memprediksi ketergantungan gen dalam garis sel kanker, Kemajuan Bioinformatika (2022). DOI: 10.1093/bioadv/vbac084
Disediakan oleh Universitas Sussex
Kutipan: Peneliti menggunakan AI untuk mempersonalisasi perawatan pasien kanker (2023, 3 Februari) diambil 5 Februari 2023 dari https://medicalxpress.com/news/2023-02-ai-personalize-cancer-patient-treatments.html
Dokumen ini tunduk pada hak cipta. Terlepas dari kesepakatan yang adil untuk tujuan studi atau penelitian pribadi, tidak ada bagian yang boleh direproduksi tanpa izin tertulis. Konten disediakan untuk tujuan informasi saja.