Layar CRISPR mengidentifikasi gen yang memodulasi respons PARPi dalam sel PCa. Skema layar CRISPR / Cas9 selebar genom. b Plot UpSet dari gen yang dipilih secara negatif dalam empat garis sel PCa seperti yang ditunjukkan. Bilah biru menunjukkan jumlah klik umum di setidaknya dua layar. c Istilah GO Teratas diperkaya dengan 67 hit umum dari pilihan negatif. d Istilah GO teratas diperkaya dalam gen yang dipilih secara negatif (panel atas) dan positif (panel bawah) di setiap garis sel individu. e Plot UpSet dari gen yang dipilih secara positif dalam empat garis sel PCa seperti yang ditunjukkan. Bilah merah menunjukkan jumlah klik umum di setidaknya dua layar. f Istilah GO Teratas diperkaya dalam 103 hit umum dari pilihan positif. g Jaringan hit umum dari seleksi negatif dikelompokkan menurut perannya dalam jalur spesifik dan interaksi genetik dan fisiknya (garis abu-abu) berdasarkan analisis STRING. h Jaringan hit umum dari seleksi positif, dikelompokkan seperti pada (g). i Gen peringkat teratas dari layar CRISPR ditentukan dengan membandingkan olaparib dengan pengobatan DMSO. Gen diberi peringkat berdasarkan rata-rata skor β diferensial dari keempat garis sel. Gen yang dipilih secara negatif dan positif masing-masing ditandai dengan warna biru dan merah. Kredit: Komunikasi Alam (2023). DOI: 10.1038/s41467-023-35880-y
Tumor kanker prostat yang menyimpan mutasi BRCA1/2 sangat sensitif terhadap penghambat PARP, sementara perubahan genom pada gen respons kerusakan DNA (DDR) lainnya kurang responsif. Untuk mengidentifikasi gen yang sebelumnya tidak diketahui yang kehilangannya berdampak besar pada respons penghambat PARP, para peneliti dari Dana-Farber Brigham Cancer Center memimpin upaya multinasional untuk melakukan layar knockout CRISPR-Cas9 di seluruh genom. Tujuan penelitian adalah untuk menginformasikan penggunaan inhibitor PARP di luar tumor yang kekurangan BRCA1/2 dan mendukung evaluasi ulang biomarker saat ini untuk penghambatan PARP pada kanker prostat.
Temuan ini dipublikasikan dalam jurnal Nature Communications.
Studi tersebut mengidentifikasi beberapa gen baru (misalnya, MMS22L dan RNASEH2B) yang sering terhapus pada kanker prostat. Gen-gen ini dapat berfungsi sebagai biomarker prediktif untuk respons penghambat PARP pada kanker prostat, menurut penelitian tersebut. Tim peneliti juga menemukan bahwa hilangnya CHEK2 (biomarker yang disetujui FDA untuk respons terapeutik terhadap olaparib) memberikan resistensi, bukan sensitivitas, terhadap penghambatan PARP.
“Terapi kanker yang ditargetkan saat ini, termasuk penghambat PARP, sebagian besar dipandu oleh mutasi gen tunggal dan mengabaikan perubahan genomik bersamaan,” kata Li Jia, Ph.D., direktur Riset Urologi, Brigham dan Rumah Sakit Wanita. “Kami menemukan bahwa sensitivitas penghambat PARP mungkin bergantung pada interaksi antara beberapa perubahan genomik. Oleh karena itu, analisis genomik yang komprehensif dapat membantu meningkatkan pengambilan keputusan klinis.”
Informasi lebih lanjut: Takuya Tsujino et al, layar CRISPR mengungkapkan faktor penentu genetik dari sensitivitas dan resistensi inhibitor PARP pada kanker prostat, Nature Communications (2023). DOI: 10.1038/s41467-023-35880-y
Disediakan oleh Rumah Sakit Brigham dan Wanita
Kutipan: Layar CRISPR seluruh genom mengidentifikasi sensitivitas dan resistensi penghambat PARP pada kanker prostat (2023, 4 April) diambil 4 April 2023 dari https://medicalxpress.com/news/2023-04-genome-wide-crispr-screens-parp -inhibitor.html
Dokumen ini tunduk pada hak cipta. Terlepas dari kesepakatan yang adil untuk tujuan studi atau penelitian pribadi, tidak ada bagian yang boleh direproduksi tanpa izin tertulis. Konten disediakan untuk tujuan informasi saja.