Ekspresi garis sel dari transkrip TE-chimeric spesifik tumor. a, Plot kotak dengan petak titik overlay dari jumlah kandidat yang diekspresikan dalam setiap garis sel kanker yang diprofilkan di berbagai jenis tumor. ‘N=’ mencantumkan jumlah garis sel di setiap petak kotak. Format petak kotak: garis tengah, median; batas kotak, kuartil atas dan bawah; kumis, rentang interkuartil 1,5x. b, Peta panas ekspresi kandidat TPM CAGE-seq di 10 garis sel kanker yang kami profilkan. Di bagian atas adalah plot titik yang menunjukkan berapa banyak sampel tumor TCGA yang dimiliki kandidat. Kredit: Genetika Alam (2023). DOI: 10.1038/s41588-023-01349-3
Para peneliti di Fakultas Kedokteran Universitas Washington, St. Louis, telah menemukan target baru yang potensial untuk imunoterapi kanker dalam elemen transposable (TEs), segmen pendek DNA yang dapat bergerak di sekitar genom.
Dalam makalah, “Analisis pan-kanker mengidentifikasi antigen spesifik tumor yang berasal dari elemen transposable” yang diterbitkan di Nature Genetics, para peneliti menggunakan Cancer Genome Atlas (TCGA), database lebih dari 20.000 sampel kanker yang mencakup 33 jenis kanker yang berbeda dan dan 675 garis sel kanker.
Makalah ini berfokus pada elemen transposable (TEs) yang ada dalam genom manusia tetapi seringkali tidak aktif. Ini adalah, seperti namanya, segmen DNA yang dapat menyisipkan diri ke dalam gen lain. Contoh klasiknya adalah retrovirus yang memasukkan beberapa kode genetiknya ke dalam genom inang. Genom disiapkan untuk intrusi semacam ini, dan replikasi serta penyisipan lanjutan biasanya “dimatikan”.
Ketika kanker berkembang, mereka melakukannya tanpa banyak kegagalan genetik normal, karena mereka sering berasal dari sel yang telah merusak DNA sejak awal. Dalam replikasi, kanker memungkinkan TE yang tidak aktif ini untuk mendapatkan kembali kemampuan transposabelnya di dalam sel kanker dan, menurut penelitian, “mendorong ekspresi transkrip atipikal yang, kadang-kadang, dapat diekspresikan secara tinggi dan dibagikan secara luas di seluruh sampel tumor.”
Karena itu, para peneliti dapat menemukan TE yang digabungkan di seluruh 98% tumor, di seluruh jenis yang berbeda, dan menemukan bahwa “transkrip ini memiliki potensi untuk menghasilkan peptida baru, yang tidak ada dalam jaringan jinak,” menyarankan cara baru. penargetan tumor, di seluruh jenis kanker.
Studi ini mengidentifikasi 1.068 kandidat TE spesifik tumor dengan potensi untuk menghasilkan antigen chimeric TE spesifik tumor (TS-TEA). Saat ini ada pengobatan kanker yang menargetkan jenis antigen tertentu, dan penelitian lebih lanjut diperlukan untuk memastikan bahwa jalur ini dapat dimanfaatkan untuk menyerang sel tumor dengan TS-TEA ini.
Ilmu kedokteran selalu beroperasi dalam langkah-langkah penemuan yang kecil dan berulang, yang mengarah ke jalur potensial yang dipenuhi peringatan untuk memahami penyembuhan. Perbedaannya di sini adalah bahwa banyak dari jalur penyembuhan tersebut telah dilalui.
Apa yang telah diungkapkan oleh penelitian ini adalah mekanisme di dalam tumor yang menciptakan kemungkinan target untuk pendekatan pengobatan yang ada. Penemuan ini dapat mengarah pada pendekatan terapeutik baru untuk pengobatan kanker, dan ada saran kuat bahwa dengan penelitian lebih lanjut, satu jenis pengobatan dapat dikembangkan untuk mengatasi berbagai jenis kanker di seluruh tubuh.
Informasi lebih lanjut: Nakul M. Shah et al, analisis Pan-kanker mengidentifikasi antigen spesifik tumor yang berasal dari elemen transposable, Nature Genetics (2023). DOI: 10.1038/s41588-023-01349-3
© 2023 Science X Network
Kutipan: Analisis seluruh kanker menemukan target luas kanker untuk pengurangan tumor (2023, 31 Maret) diambil 31 Maret 2023 dari https://medicalxpress.com/news/2023-03-cancer-wide-analysis-tumor-reduction. html
Dokumen ini tunduk pada hak cipta. Terlepas dari kesepakatan yang adil untuk tujuan studi atau penelitian pribadi, tidak ada bagian yang boleh direproduksi tanpa izin tertulis. Konten disediakan untuk tujuan informasi saja.